Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg4aQ8C9S8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Atg4aQ8C9S8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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