Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm9949Q8C9F4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm9949Q8C9F4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm9949Q8C9F4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm9949Q8C9F4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm9949Q8C9F4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9949Q8C9F4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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