Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp38Q8BW70 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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