Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssc5dQ8BV57 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssc5dQ8BV57 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssc5dQ8BV57 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssc5dQ8BV57 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssc5dQ8BV57 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssc5dQ8BV57 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc5dQ8BV57 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms