Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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