Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan9Q8BJU2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms