Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cyp4f39Q8BGU0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cyp4f39Q8BGU0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms