Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Htatsf1Q8BGC0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Htatsf1Q8BGC0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Htatsf1Q8BGC0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htatsf1Q8BGC0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
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Htatsf1Q8BGC0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms