Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms