Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.6Q85ZW5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.6Q85ZW5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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