Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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ChfrQ810L3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ChfrQ810L3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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