Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms