Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Amigo1Q80ZD8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Amigo1Q80ZD8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Amigo1Q80ZD8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Amigo1Q80ZD8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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