Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NischQ80TM9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NischQ80TM9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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