Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms