Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV1

Fam57b, Protein FAM57B, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam57bQ7TNV1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Fam57bQ7TNV1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms