Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vma21Q78T54 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Vma21Q78T54 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Vma21Q78T54 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Vma21Q78T54 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vma21Q78T54 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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