Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmed3Q78IS1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms