Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cnih3Q6ZWS4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cnih3Q6ZWS4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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