Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Topbp1Q6ZQF0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms