Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rrp12Q6P5B0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrp12Q6P5B0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms