Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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