Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ric1Q69ZJ7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ric1Q69ZJ7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ric1Q69ZJ7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ric1Q69ZJ7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ric1Q69ZJ7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ric1Q69ZJ7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ric1Q69ZJ7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ric1Q69ZJ7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ric1Q69ZJ7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ric1Q69ZJ7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms