Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkp4Q68FH0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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