Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sptbn2Q68FG2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms