Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kiaa1549Q68FD9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kiaa1549Q68FD9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms