Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ss18Q62280 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms