Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sin3bQ62141 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms