Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkciQ62074 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms