Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga6Q61739 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms