Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms