Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Mre11Q61216 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mre11Q61216 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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