Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms