Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grik1Q60934 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms