Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Slc6a4Q60857 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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