Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Traf3Q60803 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms