Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm1Q60636 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prdm1Q60636 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prdm1Q60636 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prdm1Q60636 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm1Q60636 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm1Q60636 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prdm1Q60636 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prdm1Q60636 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prdm1Q60636 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prdm1Q60636 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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