Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psme4Q5SSW2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms