Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Trappc1Q5NCF2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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