Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C2cd3Q52KB6 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms