Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Esf1Q3V1V3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms