Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ccdc185Q3V118 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ccdc185Q3V118 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccdc185Q3V118 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms