Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp48Q3V0C5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp48Q3V0C5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp48Q3V0C5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp48Q3V0C5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp48Q3V0C5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp48Q3V0C5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp48Q3V0C5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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