Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ttc9Q3V038 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ttc9Q3V038 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc9Q3V038 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc9Q3V038 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc9Q3V038 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc9Q3V038 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc9Q3V038 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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