Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Capn13Q3UW68 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms