Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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