Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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