Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms