Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrc1Q3UPH1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms