Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp19Q3UJD6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp19Q3UJD6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp19Q3UJD6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp19Q3UJD6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Usp19Q3UJD6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Usp19Q3UJD6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp19Q3UJD6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms